# Präambel #### # Pfade zu den beiden extern gepflegten Skripten, die den eigentlichen Datenzugriff # uebernehmen. Diese App selbst spricht NIE direkt mit der formr-API und oeffnet NIE # direkt die SQLite-Pseudonymdatenbank - das passiert ausschliesslich in diesen beiden # Skripten (siehe Abschnitt 3 der Spezifikation). PFAD_DOWNLOAD_SKRIPT = "../API/get_data_bai.R" # liefert beim Sourcen: daten_bai PFAD_PSEUDONYM_SKRIPT = "../get_pseudo.R" # liefert beim Sourcen: pseudo AKZENT_FARBE = "#8B2635" # Pflicht-Disclaimer, der am Ende jedes Word-Exports erscheint (Abschnitt 8). BAI_DISCLAIMER = paste0( "Diese Auswertung ist ein Hilfsmittel fuer klinisches Fachpersonal und ersetzt ", "keine klinische Diagnose. Die Interpretation obliegt der behandelnden Person." ) library(shiny) library(dplyr) library(ggplot2) library(officer) library(haven) # Infrastruktur #### APP_VERZEICHNIS = normalizePath(getwd()) absPath = function(pfad) { if (grepl("^([A-Za-z]:[/\\\\]|/)", pfad)) return(pfad) file.path(APP_VERZEICHNIS, pfad) } PFAD_DOWNLOAD_SKRIPT = normalizePath(absPath(PFAD_DOWNLOAD_SKRIPT), mustWork = FALSE) PFAD_PSEUDONYM_SKRIPT = normalizePath(absPath(PFAD_PSEUDONYM_SKRIPT), mustWork = FALSE) # Helper #### # Die vier Antwortoptionen des BAI in fester Reihenfolge, exakter formr-Choice-Wortlaut. # Die Position in diesem Vektor minus 1 ist gleichzeitig die Kodierung # (0 = "überhaupt nicht" ... 3 = "stark"). BAI_ANTWORTOPTIONEN = c( "überhaupt nicht", "wenig (Es stört mich nicht sehr)", "mittel (Es war sehr unangenehm, aber ich konnte es aushalten)", "stark (Ich konnte es kaum aushalten)" ) # Formr-Itemlabels enthalten mitunter Markdown-Sternchen - fuer die Anzeige entfernen. strip_stars = function(x) { if (is.null(x) || length(x) == 0) return(x) gsub("\\*\\*", "", as.character(x)) } # Zentrale Recoding-Funktion (Spezifikation Abschnitt 2). Wandelt den rohen formr-Wert # EINES Items fuer EINE Person in einen BAI-Wert 0-3 um. Es ist am echten formr-Export # nicht verifiziert, ob die Spalte als Choice-Text (character) oder als 1-basierter # Choice-Index (numerisch 1-4) vorliegt - beide Faelle werden hier abgedeckt. # # WICHTIG: Ob eine numerische Spalte der 1-4-Index-Konvention oder der bereits # vorkodierten 0-3-Konvention folgt, wird anhand ALLER Werte der Spalte (ueber alle # Faelle in daten_bai) bestimmt, nicht anhand des einzelnen Werts dieser Person. Ein # einzelner Wert wie "1" waere sonst nicht eindeutig zwischen Choice-Index 1 # ("ueberhaupt nicht", Kodierung 0) und einem bereits vorkodierten Wert 1 ("wenig") # unterscheidbar. Deshalb erhaelt die Funktion die gesamte Spalte (spalte_gesamt) als # Referenz zusaetzlich zum Einzelwert dieser Person (roh_wert). bai_recode_item = function(item_name, spalte_gesamt, roh_wert) { if (length(roh_wert) == 0 || is.na(roh_wert)) return(NA_integer_) if (is.character(spalte_gesamt)) { text = trimws(as.character(roh_wert)) idx = match(text, BAI_ANTWORTOPTIONEN) if (is.na(idx)) { stop(paste0( "Item '", item_name, "': unbekannter Antworttext >>", text, "<< ", "(erwartet wird einer der vier BAI-Antworttexte)." )) } return(idx - 1L) } if (is.numeric(spalte_gesamt)) { alle_werte = spalte_gesamt[!is.na(spalte_gesamt)] wert = suppressWarnings(as.numeric(roh_wert)) ist_index_kodierung = length(alle_werte) > 0 && all(alle_werte >= 1 & alle_werte <= 4) ist_vorkodiert = length(alle_werte) > 0 && all(alle_werte >= 0 & alle_werte <= 3) if (ist_index_kodierung) { if (is.na(wert) || wert < 1 || wert > 4) { stop(paste0( "Item '", item_name, "': unerwarteter Rohwert >>", roh_wert, "<< ", "(Spalte folgt erkennbar der 1-4 Index-Kodierung)." )) } return(as.integer(round(wert)) - 1L) } if (ist_vorkodiert) { if (is.na(wert) || wert < 0 || wert > 3) { stop(paste0( "Item '", item_name, "': unerwarteter Rohwert >>", roh_wert, "<< ", "(Spalte folgt erkennbar der 0-3 Kodierung)." )) } return(as.integer(round(wert))) } stop(paste0( "Item '", item_name, "': Werte der Spalte liegen ausserhalb des erwarteten ", "Bereichs (weder durchgehend 1-4 noch durchgehend 0-3). Rohwert dieser Person: >>", roh_wert, "<<." )) } stop(paste0( "Item '", item_name, "': unerwarteter Spaltentyp (", class(spalte_gesamt)[1], "), weder Text noch Zahl." )) } # Itemtitel aus dem formr-Label der Spalte, mit Fallback, falls kein Label vorhanden ist. bai_hole_item_titel = function(spalte, fallback) { lbl = attr(spalte, "label") if (is.null(lbl) || length(lbl) == 0 || is.na(lbl[1]) || nchar(trimws(as.character(lbl[1]))) == 0) { return(fallback) } trimws(strip_stars(lbl[1])) } # Sucht die erste vorhandene, fuer diese Zeile nicht-NA Datumsspalte. Der genaue # formr-Feldname fuer das Ausfuelldatum ist nicht verifiziert (siehe Abschnitt 8) - # deshalb wird der Reihe nach eine Liste plausibler Kandidaten geprueft, statt blind # einen Namen anzunehmen. bai_finde_datumsspalte = function(daten, zeile) { kandidaten = c("ended", "created", "modified", "expired") for (k in kandidaten) { if (k %in% names(daten)) { wert = zeile[[k]][1] if (!is.null(wert) && !is.na(wert)) return(k) } } NA_character_ } # Robustes Parsen eines Datumswerts zu POSIXct. Faellt bei nicht auswertbarem Format # auf NULL zurueck (kein Rateergebnis), der Aufrufer entscheidet dann ueber einen # sichtbaren Fallback auf das aktuelle Datum. bai_parse_datum = function(roh_wert) { tryCatch({ d = as.POSIXct(roh_wert) if (is.na(d)) return(NULL) d }, error = function(e) NULL) } # Datenaufbereitung #### # Klassifikationstabelle des BAI (Abschnitt 5.4): vier Kategorien nach Gesamtscore # (0-63). Zentral als Datenstruktur abgelegt, damit Gauge-Zonen, Bildschirmanzeige und # Word-Export dieselbe Quelle verwenden - keine verstreute if-Kette an mehreren Stellen. BAI_KLASSIFIKATION = data.frame( min = c(0, 8, 16, 26), max = c(7, 15, 25, 63), label = c("minimale Angst", "leichte Angst", "moderate Angst", "schwere Angst"), farbe = c("#2E7D32", "#F57F17", "#E65100", "#B71C1C"), stringsAsFactors = FALSE ) # Zusaetzlicher dichotomer Cutoff (Abschnitt 5.5), unabhaengig von der vierstufigen # Kategorie. BAI_CUTOFF = 8 bai_klassifiziere = function(score) { if (is.na(score)) { return(list(text = "nicht berechenbar", bereich = "", farbe = "#888888")) } for (i in seq_len(nrow(BAI_KLASSIFIKATION))) { if (score >= BAI_KLASSIFIKATION$min[i] && score <= BAI_KLASSIFIKATION$max[i]) { return(list( text = BAI_KLASSIFIKATION$label[i], bereich = paste0(BAI_KLASSIFIKATION$min[i], "-", BAI_KLASSIFIKATION$max[i], " Punkte"), farbe = BAI_KLASSIFIKATION$farbe[i] )) } } list(text = "nicht klassifizierbar", bereich = "", farbe = "#888888") } bai_cutoff_hinweis = function(score) { if (is.na(score)) { return(list(ueberschritten = NA, text = "nicht berechenbar")) } if (score > BAI_CUTOFF) { list( ueberschritten = TRUE, text = paste0("Hinweis auf moegliche Angststoerung (Cutoff > ", BAI_CUTOFF, ", Sensitivitaet .91 / Spezifitaet .92)") ) } else { list(ueberschritten = FALSE, text = "kein Hinweis auf Cutoff-Ueberschreitung") } } erstelle_gauge_bai = function(score) { zonen = BAI_KLASSIFIKATION zonen$zone_pastell = c("#C8E6C9", "#FFF3C4", "#FFCC9C", "#FFCDD2") zonen$zone = factor(zonen$label, levels = zonen$label) zonen$mitte = (zonen$min + zonen$max) / 2 zonen$zone_label = paste0(zonen$label, "\n", zonen$min, "-", zonen$max) p = ggplot() + geom_rect(data = zonen, aes(xmin = min, xmax = max, ymin = 0, ymax = 1, fill = zone), colour = "white", linewidth = 1) + scale_fill_manual(values = setNames(zonen$zone_pastell, zonen$zone), guide = "none") + annotate("text", x = zonen$mitte, y = 0.5, label = zonen$zone_label, size = 2.7, colour = "#444444", fontface = "bold", lineheight = 0.9) + scale_x_continuous(limits = c(0, 63), expand = c(0, 0), breaks = c(0, 8, 16, 26, 63)) + scale_y_continuous(limits = c(-0.25, 1.35), expand = c(0, 0)) + labs(x = "Summenscore (0-63)", y = NULL) + theme_minimal(base_size = 11) + theme( axis.text.y = element_blank(), axis.ticks.y = element_blank(), panel.grid = element_blank(), plot.background = element_rect(fill = "white", colour = NA), panel.background = element_rect(fill = "white", colour = NA), axis.line.x = element_line(colour = "#cccccc", linewidth = 0.5), axis.text.x = element_text(colour = "#666666", size = 9) ) if (!is.na(score)) { p = p + geom_segment(aes(x = score, xend = score, y = -0.1, yend = 1.1), colour = AKZENT_FARBE, linewidth = 2.5, lineend = "round") + annotate("text", x = score, y = 1.26, label = as.character(score), colour = AKZENT_FARBE, fontface = "bold", size = 4.2) } p } # UI #### app_css = " body { font-family: 'Segoe UI', Helvetica, Arial, sans-serif; background-color: #f4f4f4; color: #222; font-size: 14px; } .app-header { background-color: #8B2635; color: white; padding: 15px 22px 13px; margin-bottom: 18px; border-radius: 5px; } .app-header h2 { margin: 0; font-size: 1.4em; font-weight: 700; } .app-header p { margin: 4px 0 0; font-size: 0.87em; opacity: 0.88; } .input-panel { display: flex; align-items: flex-end; gap: 10px; background: white; border-radius: 6px; padding: 14px 18px; margin-bottom: 16px; box-shadow: 0 1px 4px rgba(0,0,0,0.09); flex-wrap: wrap; } .input-panel .form-group { margin-bottom: 0; } .btn-laden { background-color: #8B2635 !important; border-color: #7A2030 !important; color: white !important; font-weight: 600; padding: 6px 18px; border-radius: 4px; letter-spacing: 0.02em; white-space: nowrap; } .btn-laden:hover, .btn-laden:focus { background-color: #6E1E29 !important; border-color: #6E1E29 !important; outline: none; box-shadow: 0 0 0 2px rgba(139,38,53,0.3) !important; } .abschnitt-karte { background: white; border-radius: 6px; padding: 16px 20px; margin-bottom: 14px; box-shadow: 0 1px 4px rgba(0,0,0,0.09); } .abschnitt-titel { color: #8B2635; margin-top: 0; margin-bottom: 12px; font-size: 1em; font-weight: 700; letter-spacing: 0.01em; } .kopf-info { color: #555; font-size: 0.92em; padding-bottom: 10px; border-bottom: 1px solid #eee; margin-bottom: 8px; } .kopf-info b { color: #333; } .alert-warnung { background-color: #FFFDE7; border-left: 4px solid #F9A825; border-radius: 3px; padding: 9px 12px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.88em; color: #555; line-height: 1.45; } .alert-fehler { background-color: #FEECEB; border-left: 4px solid #C62828; border-radius: 4px; padding: 13px 16px; margin-bottom: 12px; } .alert-fehler h4 { color: #C62828; margin-top: 0; margin-bottom: 8px; } .alert-fehler p, .alert-fehler li { color: #444; font-size: 0.92em; } .score-label { font-size: 0.8em; color: #999; display: block; margin-bottom: 2px; } .score-zahl { font-size: 3em; font-weight: 800; color: #8B2635; display: block; line-height: 1.1; } .klasse-text { font-size: 1.05em; font-weight: 700; display: block; margin-top: 4px; } .bereich-text { font-size: 0.8em; color: #888; display: block; margin-top: 2px; } .cutoff-badge { display: inline-block; margin-top: 10px; padding: 6px 12px; border-radius: 4px; font-size: 0.88em; font-weight: 600; } .cutoff-badge-ja { background-color: #FEECEB; color: #B71C1C; border: 1px solid #F5C6C2; } .cutoff-badge-nein { background-color: #E8F5E9; color: #2E7D32; border: 1px solid #C8E6C9; } .item-zeile { display: flex; align-items: baseline; gap: 10px; padding: 7px 0; border-bottom: 1px solid #f0f0f0; } .item-zeile:last-child { border-bottom: none; } .item-nr { font-weight: 700; color: #8B2635; min-width: 26px; flex-shrink: 0; } .item-text { flex: 1; color: #333; font-size: 0.92em; } .stufe-badge { display: inline-block; border-radius: 3px; padding: 2px 8px; font-size: 0.85em; font-weight: 700; min-width: 150px; text-align: center; flex-shrink: 0; } .stufe-badge-0 { background-color: #C8E6C9; color: #1B5E20; } .stufe-badge-1 { background-color: #FFCDD2; color: #B71C1C; } .stufe-badge-2 { background-color: #EF9A9A; color: #7B0000; } .stufe-badge-3 { background-color: #B71C1C; color: white; } .start-hinweis { text-align: center; color: #bbb; padding: 40px 0; font-size: 0.95em; } " app_css = gsub("#8B2635", AKZENT_FARBE, app_css, fixed = TRUE) ui = fluidPage( tags$head( tags$meta(charset = "UTF-8"), tags$style(HTML(app_css)) ), div(class = "app-header", tags$h2("BAI Auswertung"), tags$p("Beck Angst-Inventar • Einzelfall-Auswertung") ), div(class = "input-panel", div(style = "min-width: 360px; white-space: nowrap;", textInput("pseudonym", label = tagList( "Pseudonym", tags$span(style = "font-weight: normal; font-style: italic; font-size: 0.78em; color: #888; margin-left: 4px; white-space: nowrap;", "optional, hat Vorrang vor Chiffre") ), placeholder = "optional", width = "340px") ), div(style = "min-width: 200px;", textInput("chiffre", label = "Patientenchiffre", placeholder = "z.B. P000123", width = "100%") ), actionButton("btn_suchen", "Auswerten", class = "btn btn-primary btn-laden"), div(style = "margin-left: auto;", downloadButton("download_word", "Word-Export (.docx)") ) ), uiOutput("ergebnis_ui") ) # Word-Export #### erstelle_bai_docx = function(erg) { fmt_titel = fp_text(color = AKZENT_FARBE, bold = TRUE, font.size = 18) fmt_meta = fp_text(color = "#555555", bold = FALSE, font.size = 10) fmt_warn = fp_text(color = "#B8860B", italic = TRUE, font.size = 9) fmt_score_l = fp_text(color = "#888888", bold = FALSE, font.size = 10) fmt_score = fp_text(color = AKZENT_FARBE, bold = TRUE, font.size = 22) fmt_klasse = fp_text(color = erg$klasse$farbe, bold = TRUE, font.size = 12) fmt_cutoff = fp_text( color = if (isTRUE(erg$cutoff$ueberschritten)) "#B71C1C" else "#2E7D32", bold = TRUE, font.size = 10 ) fmt_abschn = fp_text(color = AKZENT_FARBE, bold = TRUE, font.size = 12, underlined = TRUE) fmt_item_nr = fp_text(color = "#888888", bold = TRUE, font.size = 10) fmt_item_tit = fp_text(color = "#333333", bold = FALSE, font.size = 10) fmt_disclaimer = fp_text(color = "#888888", italic = TRUE, font.size = 9) stufe_bg = function(stufe) { c("#C8E6C9", "#FFCDD2", "#EF9A9A", "#B71C1C")[stufe + 1L] } stufe_fg = function(stufe) { if (stufe < 3L) "#333333" else "#FFFFFF" } doc = read_docx() doc = body_add_fpar(doc, fpar(ftext("BAI Auswertung", fmt_titel))) doc = body_add_fpar(doc, fpar(ftext( paste0("Chiffre: ", erg$chiffre, " Ausfuelldatum: ", erg$ausfuelldatum, " Erstellt: ", format(Sys.Date(), "%d.%m.%Y")), fmt_meta ))) if (!is.null(erg$warnung_mehrfach)) { doc = body_add_fpar(doc, fpar(ftext(paste0("Hinweis: ", erg$warnung_mehrfach), fmt_warn))) } if (erg$n_fehlt > 0) { doc = body_add_fpar(doc, fpar(ftext(paste0( "Hinweis: ", erg$n_fehlt, " Item(s) ohne Angabe, mit dem Wert 0 in den ", "Summenscore eingerechnet." ), fmt_warn))) } doc = body_add_par(doc, "") doc = body_add_fpar(doc, fpar( ftext("Summenscore: ", fmt_score_l), ftext(as.character(erg$gesamtscore), fmt_score) )) doc = body_add_fpar(doc, fpar(ftext( paste0(erg$klasse$text, " (", erg$klasse$bereich, ")"), fmt_klasse ))) doc = body_add_fpar(doc, fpar(ftext(erg$cutoff$text, fmt_cutoff))) doc = body_add_par(doc, "") doc = body_add_fpar(doc, fpar(ftext("Einzelitems (21 Items)", fmt_abschn))) for (it in erg$items) { doc = body_add_fpar(doc, fpar( ftext(sprintf("%2d. ", it$nr), fmt_item_nr), ftext(paste0(it$titel, " "), fmt_item_tit), ftext(paste0(" ", it$antwort_text, " "), fp_text(color = stufe_fg(it$wert), bold = TRUE, font.size = 9, shading.color = stufe_bg(it$wert))) )) } doc = body_add_par(doc, "") doc = body_add_fpar(doc, fpar(ftext(BAI_DISCLAIMER, fmt_disclaimer))) doc } # Server #### server = function(input, output, session) { # --- pseudonym-support-injection v1 --- observe({ query = parseQueryString(session$clientData$url_search) if (!is.null(query$pseudonym) && nchar(trimws(query$pseudonym)) > 0) { updateTextInput(session, "pseudonym", value = trimws(query$pseudonym)) } }) observe({ query = parseQueryString(session$clientData$url_search) if (!is.null(query$chiffre) && nchar(trimws(query$chiffre)) > 0) { updateTextInput(session, "chiffre", value = toupper(trimws(query$chiffre))) } }) # Die beiden externen Skripte werden bewusst NICHT beim App-Start gesourct, sondern # erst hier, beim Klick auf "Auswerten" (Source-bei-Klick-Muster, Abschnitt 3). ergebnis_r = eventReactive(input$btn_suchen, { chiffre = toupper(trimws(input$chiffre)) if ((nchar(trimws(input$pseudonym)) == 0 && nchar(chiffre) == 0)) { return(list(typ = "leere_eingabe")) } if (!(nchar(trimws(input$pseudonym)) > 0 || grepl("^[A-Z][0-9]{6}$", chiffre))) { return(list(typ = "format_fehler", chiffre = chiffre)) } pfadfehler = character(0) if (!file.exists(PFAD_DOWNLOAD_SKRIPT)) { pfadfehler = c(pfadfehler, paste0("Download-Skript nicht gefunden: >>", PFAD_DOWNLOAD_SKRIPT, "<<")) } if (!file.exists(PFAD_PSEUDONYM_SKRIPT)) { pfadfehler = c(pfadfehler, paste0("Pseudonym-Skript nicht gefunden: >>", PFAD_PSEUDONYM_SKRIPT, "<<")) } if (length(pfadfehler) > 0) { return(list(typ = "skript_fehler", meldung = paste("Bitte Pfade am Kopf der app.R anpassen:", paste(pfadfehler, collapse = "\n"), sep = "\n"))) } # Schritt 4: Download-Skript sourcen. Achtung: Rueckgabewert-Pattern exakt so, kein # `<=` statt `=` - das waere syntaktisch gueltig, aber semantisch ein stiller Bug. ok_download = tryCatch({ source(PFAD_DOWNLOAD_SKRIPT, local = FALSE) list(ok = TRUE) }, error = function(e) list(ok = FALSE, msg = conditionMessage(e))) if (!ok_download$ok) { return(list(typ = "skript_fehler", meldung = paste0("Fehler im Download-Skript (", basename(PFAD_DOWNLOAD_SKRIPT), "):\n", ok_download$msg))) } # Schritt 5: Ordner mit pseudonyme.db suchen, ausgehend vom Pseudonym-Skript-Ordner, # bis zu 5 Ebenen nach oben. db_ordner = local({ ordner = dirname(normalizePath(PFAD_PSEUDONYM_SKRIPT, mustWork = FALSE)) gefunden = NULL for (i in 1:5) { if (file.exists(file.path(ordner, "pseudonyme.db"))) { gefunden = ordner; break } elternteil = dirname(ordner) if (elternteil == ordner) break ordner = elternteil } gefunden }) if (is.null(db_ordner)) { return(list(typ = "skript_fehler", meldung = paste0( "pseudonyme.db nicht gefunden.\n", "Gesucht ausgehend vom Pseudonym-Skript-Ordner bis zu 5 Ebenen nach oben.\n", "Bitte sicherstellen, dass pseudonyme.db im selben oder einem ", "uebergeordneten Ordner liegt." ))) } # Schritt 6+7: Arbeitsverzeichnis fuer die Dauer des Sourcens auf den DB-Ordner # setzen (das Pseudonym-Skript oeffnet die DB relativ) und danach zuverlaessig # zuruecksetzen. add = TRUE ist Pflicht, sonst wuerden ggf. bereits registrierte # on.exit()-Handler ueberschrieben statt ergaenzt. ok_pseudonym = tryCatch({ alter_wd = getwd() on.exit(setwd(alter_wd), add = TRUE) setwd(db_ordner) source(PFAD_PSEUDONYM_SKRIPT, local = FALSE) if (nchar(trimws(input$pseudonym)) > 0) { .pw_wert = trimws(input$pseudonym) .pw_tab = get("pseudo", envir = .GlobalEnv) .pw_treffer = .pw_tab[.pw_tab$pseudonym == .pw_wert, ] if (nrow(.pw_treffer) > 0) chiffre = toupper(trimws(.pw_treffer$chiffre[1])) } list(ok = TRUE) }, error = function(e) list(ok = FALSE, msg = conditionMessage(e))) if (!ok_pseudonym$ok) { return(list(typ = "skript_fehler", meldung = paste0("Fehler im Pseudonym-Skript (", basename(PFAD_PSEUDONYM_SKRIPT), "):\n", ok_pseudonym$msg))) } # Schritt 8: pruefen, ob beide Skripte tatsaechlich die erwarteten Objekte geliefert # haben. if (!exists("daten_bai", envir = .GlobalEnv)) { return(list(typ = "skript_fehler", meldung = paste0("Objekt 'daten_bai' fehlt nach dem Sourcen von:\n", PFAD_DOWNLOAD_SKRIPT))) } if (!exists("pseudo", envir = .GlobalEnv)) { return(list(typ = "skript_fehler", meldung = paste0("Objekt 'pseudo' fehlt nach dem Sourcen von:\n", PFAD_PSEUDONYM_SKRIPT))) } dat_bai = get("daten_bai", envir = .GlobalEnv) dat_ps = get("pseudo", envir = .GlobalEnv) # Schritt 9: Chiffre-Lookup. Kein Filter auf 'instrument' noetig, da diese App nur # Daten dieses einen BAI-Runs erhaelt (Abschnitt 3). ps_treffer = dat_ps[dat_ps$chiffre == chiffre, , drop = FALSE] if (nrow(ps_treffer) == 0) { return(list(typ = "chiffre_nicht_gefunden", chiffre = chiffre)) } alle_session_ids = unique(as.character(ps_treffer$pseudonym)) if (nchar(trimws(input$pseudonym)) > 0) alle_session_ids = trimws(input$pseudonym) if (!("session" %in% names(dat_bai))) { return(list(typ = "skript_fehler", meldung = paste0( "Spalte 'session' in 'daten_bai' nicht gefunden. Der erwartete Spaltenname ", "fuer die formr-Session-ID ist am echten Export noch nicht verifiziert - ", "bitte tatsaechlichen Spaltennamen in get_data_bai.R bzw. hier pruefen." ))) } bai_treffer = dat_bai[dat_bai$session %in% alle_session_ids, , drop = FALSE] if (nrow(bai_treffer) == 0) { return(list(typ = "keine_daten", chiffre = chiffre)) } # Mehrfachtreffer (Bogen mehrfach ausgefuellt): nicht stillschweigend den ersten # nehmen, sondern den neuesten (nach Ausfuelldatum) waehlen und sichtbar warnen. warnung_mehrfach = NULL if (nrow(bai_treffer) > 1) { n_ausfuell = nrow(bai_treffer) spalte_datum = bai_finde_datumsspalte(dat_bai, bai_treffer[1, , drop = FALSE]) if (!is.na(spalte_datum)) { reihenfolge = order( vapply(seq_len(n_ausfuell), function(i) { d = bai_parse_datum(bai_treffer[[spalte_datum]][i]) if (is.null(d)) -Inf else as.numeric(d) }, numeric(1)), decreasing = TRUE ) bai_treffer = bai_treffer[reihenfolge, , drop = FALSE] } datum_neuestes = if (!is.na(spalte_datum)) { d = bai_parse_datum(bai_treffer[[spalte_datum]][1]) if (!is.null(d)) format(d, "%d.%m.%Y %H:%M") else "unbekanntes Datum" } else "unbekanntes Datum" warnung_mehrfach = paste0( "Es wurden ", n_ausfuell, " Ausfuellungen gefunden, es wird die neueste vom ", datum_neuestes, " angezeigt." ) bai_treffer = bai_treffer[1, , drop = FALSE] } zeile = bai_treffer[1, , drop = FALSE] spalte_datum = bai_finde_datumsspalte(dat_bai, zeile) datum_geparst = if (!is.na(spalte_datum)) bai_parse_datum(zeile[[spalte_datum]][1]) else NULL ausfuelldatum_fallback = is.null(datum_geparst) ausfuelldatum = if (!ausfuelldatum_fallback) format(datum_geparst, "%d.%m.%Y") else format(Sys.Date(), "%d.%m.%Y") ausfuelldatum_dateikennung = if (!ausfuelldatum_fallback) format(datum_geparst, "%Y%m%d") else format(Sys.Date(), "%Y%m%d") # 21 Items einlesen und rekodieren (0-3). Bei unerwarteten Rohwerten bricht # bai_recode_item() mit einer klaren Fehlermeldung ab (kein stilles NA). item_cols = sprintf("bai_%02d", 1:21) fehlende_item_spalten = item_cols[!(item_cols %in% names(dat_bai))] if (length(fehlende_item_spalten) > 0) { return(list(typ = "skript_fehler", meldung = paste0( "Folgende erwartete Item-Spalten fehlen in 'daten_bai': ", paste(fehlende_item_spalten, collapse = ", "), "." ))) } recode_ergebnis = tryCatch({ liste = lapply(seq_along(item_cols), function(i) { col = item_cols[i] spalte_gesamt = dat_bai[[col]] roh_wert = zeile[[col]][1] wert = bai_recode_item(col, spalte_gesamt, roh_wert) titel = bai_hole_item_titel(spalte_gesamt, paste0("Item ", i)) list(nr = i, titel = titel, wert = wert, fehlt = is.na(wert)) }) list(ok = TRUE, items = liste) }, error = function(e) list(ok = FALSE, msg = conditionMessage(e))) if (!recode_ergebnis$ok) { return(list(typ = "daten_fehler", meldung = recode_ergebnis$msg)) } items = recode_ergebnis$items # Missing-Value-Regel (Abschnitt 5.2). n_fehlt = sum(vapply(items, `[[`, logical(1), "fehlt")) if (n_fehlt > 3) { return(list(typ = "zu_viele_fehlende_werte", n_fehlt = n_fehlt, chiffre = chiffre)) } # Fehlende Items (1-3 Stueck) mit 0 in den Summenscore einrechnen. items = lapply(items, function(it) { if (it$fehlt) it$wert = 0L it }) items = lapply(items, function(it) { it$antwort_text = if (it$fehlt) { paste0("(fehlend, als '", BAI_ANTWORTOPTIONEN[1], "' gewertet)") } else { BAI_ANTWORTOPTIONEN[it$wert + 1L] } it }) gesamtscore = as.integer(sum(vapply(items, `[[`, integer(1), "wert"))) klasse = bai_klassifiziere(gesamtscore) cutoff = bai_cutoff_hinweis(gesamtscore) list( typ = "ergebnis", chiffre = chiffre, ausfuelldatum = ausfuelldatum, ausfuelldatum_fallback = ausfuelldatum_fallback, ausfuelldatum_dateikennung = ausfuelldatum_dateikennung, warnung_mehrfach = warnung_mehrfach, items = items, n_fehlt = n_fehlt, gesamtscore = gesamtscore, klasse = klasse, cutoff = cutoff ) }) output$ergebnis_ui = renderUI({ if (input$btn_suchen == 0) { return(div(class = "start-hinweis", "Patientenchiffre eingeben und auf \"Auswerten\" klicken." )) } erg = ergebnis_r() if (erg$typ == "skript_fehler") { return(div(class = "alert-fehler", tags$h4("Konfigurationsfehler"), tags$pre(style = "font-size:0.88em; white-space:pre-wrap;", erg$meldung) )) } if (erg$typ == "daten_fehler") { return(div(class = "alert-fehler", tags$h4("Datenfehler"), tags$p("Beim Verarbeiten der Item-Antworten ist ein unerwarteter Wert aufgetreten:"), tags$pre(style = "font-size:0.88em; white-space:pre-wrap;", erg$meldung) )) } if (erg$typ == "leere_eingabe") { return(div(class = "alert-warnung", "Bitte eine Patientenchiffre eingeben." )) } if (erg$typ == "format_fehler") { return(div(class = "alert-warnung", "Ungueltige Chiffre. Erwartet wird ein Grossbuchstabe gefolgt von 6 Ziffern, ", "z.B. P000123." )) } if (erg$typ == "chiffre_nicht_gefunden") { return(div(class = "alert-fehler", tags$h4("Chiffre nicht gefunden"), tags$p("Die Chiffre ", tags$b(paste0("«", erg$chiffre, "»")), " ist in der Pseudonymtabelle nicht vorhanden."), tags$p("Bitte Schreibweise pruefen oder Pseudonymtabelle aktualisieren.") )) } if (erg$typ == "keine_daten") { return(div(class = "alert-fehler", tags$h4("Kein BAI-Datensatz gefunden"), tags$p("Zur Chiffre ", tags$b(paste0("«", erg$chiffre, "»")), " existiert ein Pseudonymeintrag, aber kein Datensatz in ", tags$code("daten_bai"), "."), tags$p("Moegliche Ursachen: Bogen noch nicht ausgefuellt, ", "oder Daten noch nicht heruntergeladen.") )) } if (erg$typ == "zu_viele_fehlende_werte") { return(div(class = "alert-fehler", tags$h4("Zu viele fehlende Werte"), tags$p("Bei ", tags$b(paste0("«", erg$chiffre, "»")), " fehlen ", erg$n_fehlt, " von 21 Items."), tags$p("Der Bogen kann laut Auswertungsregel nicht ausgewertet werden ", "(zulaessig sind maximal 3 fehlende Items).") )) } # typ == "ergebnis" kopf_block = div(class = "abschnitt-karte", div(class = "kopf-info", tags$b("Chiffre: "), erg$chiffre, " ", tags$b("Ausfuelldatum: "), erg$ausfuelldatum ), if (!is.null(erg$warnung_mehrfach)) div(class = "alert-warnung", "⚠ Hinweis: ", erg$warnung_mehrfach), if (isTRUE(erg$ausfuelldatum_fallback)) div(class = "alert-warnung", "⚠ Ausfuelldatum nicht in den Daten gefunden, Erstellungsdatum verwendet."), if (erg$n_fehlt > 0) div(class = "alert-warnung", "⚠ ", erg$n_fehlt, " Item(s) ohne Angabe, mit dem Wert 0 in den Summenscore eingerechnet.") ) score_block = div(class = "abschnitt-karte", fluidRow( column(4, tags$span(class = "score-label", "Summenscore BAI"), tags$span(class = "score-zahl", as.character(erg$gesamtscore)), tags$span(class = "klasse-text", style = paste0("color:", erg$klasse$farbe, ";"), erg$klasse$text ), tags$span(class = "bereich-text", erg$klasse$bereich), tags$span( class = paste0("cutoff-badge ", if (isTRUE(erg$cutoff$ueberschritten)) "cutoff-badge-ja" else "cutoff-badge-nein"), erg$cutoff$text ) ), column(8, style = "padding-top: 6px;", plotOutput("gauge_plot", height = "110px") ) ) ) item_zeilen = lapply(erg$items, function(it) { div(class = "item-zeile", div(class = "item-nr", paste0(it$nr, ".")), div(class = "item-text", it$titel), tags$span(class = paste0("stufe-badge stufe-badge-", it$wert), it$antwort_text) ) }) item_block = div(class = "abschnitt-karte", tags$h4(class = "abschnitt-titel", "Einzelitems (21 Items)"), div(item_zeilen) ) tagList(kopf_block, score_block, item_block) }) output$gauge_plot = renderPlot({ req(input$btn_suchen > 0) erg = ergebnis_r() req(erg$typ == "ergebnis") erstelle_gauge_bai(erg$gesamtscore) }, bg = "white") output$download_word = downloadHandler( filename = function() { erg = ergebnis_r() if (is.null(erg) || erg$typ != "ergebnis") return("BAI_Auswertung.docx") chiffre_esc = gsub("[^A-Za-z0-9_-]", "_", erg$chiffre) # Dateiname mit dem Ausfuelldatum AUS DEN DATEN (nicht Sys.Date()), bereits beim # Einlesen robust geparst (Abschnitt 8) - kein erneutes, fehleranfaelliges # Reparsen des Anzeigetexts noetig. paste0("BAI_", chiffre_esc, "_", erg$ausfuelldatum_dateikennung, ".docx") }, content = function(file) { req(ergebnis_r()$typ == "ergebnis") erg = ergebnis_r() doc = erstelle_bai_docx(erg) print(doc, target = file) } ) } # Start #### shinyApp(ui = ui, server = server)